男科于1989年初成立，是安徽省省级医院第一家男性病专科，也是在全国成立较早的专门诊治男性疾病的专科之一，是安徽省中医药学会男科专业委员会、安徽省性学会男科专业委员会挂靠单位，经过二十余年的积淀与发展，该科已成为安徽省著名的男性疾病诊疗中心及教学、科研基地。