上海长征医院是一所集医疗、教学、科研为一体的综合性三级甲等医院，院址在上海市黄浦区凤阳路415号，南京分院在南京市建宁路200号。医院编制为军队正师级单位。院领导、机关干部为现役军官，在编的专业技术人员为现役文职干部，1955年10月1日。中华人民共和国国防部颁发命令，建立第二军医大学急症外科医院。1956年4月28日开院。院址在上海市黄浦区汉口路515号，对外称上海急症外科医院。1958年9月1日。解放军总参谋部、总后勤部联合通知，第二军医大学急症外科医院命名为第二军医大学第二附属医院。自此医院由专科医院扩建为综合性教学医院。1959年9月，医院迁至黄浦区凤阳路415号。

对外院名改为上海同济医院。1966年9月，对外院名改为上海长征医院，1969年10月，上海长征医院随第二军医大学迁到西安市。1975年7月。医院迁回上海原址，对外仍沿用上海长征医院院名至今。2004年11月，南京军医学院第四一四医院归建第二军医大学后移交给第二附属医院管理，对外称上海长征医院南京分院。2003年4月。上海市卫生局批准委托长征医院管理闸北区中心医院（托管）。